第383章 两片叶子的战争

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    凌晨六点十一分,地下工作室的ThinkPad发出一声短促的提示音。
    钱解放从行军床上翻起来,拖鞋都没穿就蹿到操作台前。
    屏幕上MinKNOW的实时面板显示:总产出17.2Gb,活跃孔数从开机时的1247降到了389——Flowcell快跑废了,但数据量已经远超预期。
    小周揉着眼睛凑过来,敲了几行命令调出质控摘要。
    「N50到了28kb,覆盖度大概十八倍。对一个草图来说,够了。」
    钱解放盯着屏幕上密密麻麻的硷基统计表,一个字母都看不懂,但他认识那个绿色的进度条——跑满了。
    「打电话。」
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    小周拨通何建邦的号码,响了两声就接了。
    何建邦显然也没睡。
    「数据出来了?传给我。我这边伺服器开着。」
    文件传输走的是K搭建的加密通道,四十分钟后,17.2Gb的原始数据完整落地到长湘医科大药学院的计算伺服器上。
    何建邦的另一个博士生小陈负责组装,用的是Flye加两轮Medaka抛光,整个流程自动化脚本跑起来,预计下午三点前出结果。
    罗明宇七点到医院,先上二楼ICU看了楚建国——血气分析正常,腹部软,引流管已经没什么东西出来了,胃管昨天夜里拔的,今早喝了半碗白粥没吐。
    「拔完胃管多久了?」
    「六个小时。」张波翻着护理记录。
    「再观察一天。明天如果排气正常,转普通病房。」
    张波在医嘱单上写的时候犹豫了一下:「楚太太昨天没来。」
    「嗯。」
    「今天也没来。」
    罗明宇没接话。
    陈芸从银泰中心回来之后再没出现过,楚建国清醒后问了一次老婆在哪,张波说出去办事了。
    这个谎不知道还能撑几天。
    护士站的牛奶和橘子照旧放着。
    ---
    上午九点半,门诊。
    第三个号是个四十出头的计程车司机,右肩疼了三个月,举不过头顶。
    在市中医院拍过片子,骨头没事,诊断肩周炎,吃了两盒布洛芬,贴了十几张膏药,没用。
    罗明宇让他把衣服脱了,右肩外展到六十度就上不去了,再往上顶就疼得龇牙咧嘴。
    但被动活动的时候,角度能到一百四。
    不是肩周炎。
    肩周炎的特徵是主动被动都受限,叫「冻结肩」。
    这个人被动活动没问题,说明关节囊没粘连,问题出在肌腱。
    罗明宇让他做了个空罐试验——大拇指朝下丶手臂前举抵抗阻力。
    司机脸上疼出汗。
    冈上肌腱炎,大概率有部分撕裂。
    「做个肩关节核磁。」
    司机脸上的表情变了。「核磁多少钱?」
    「四百多。」
    「能不能先不做?我就想开点药——」
    「药治不了这个。你的肌腱可能撕了一部分,不确认程度,后面治疗方向就是瞎蒙。」
    司机搓了半天手。
    「罗大夫,我跑一天车流水也就三四百……」
    罗明宇抬头看了他一眼。
    这双手指关节粗大丶虎口有厚茧,方向盘握出来的。
    「你先去做。回头拿片子来找我,我给你想办法。」
    司机走了之后,张波在旁边嘀咕了一句:「又一个。」
    「又一个什么?」
    「又一个你要想办法的。」
    罗明宇没理他,叫下一个号。
    ---
    下午两点十七分,何建邦打来电话。
    「组装出来了。」
    罗明宇正在给一个慢阻肺老太太写处方,笔停在纸上。
    「基因组总长估计九亿三千万硷基对,比预期大。ScaffoldN50到了1.2Mb,连续性很好。」何建邦的声音里藏着兴奋,但压着。「重点是——BUSCO完整度88.4%,对一个nanopore草图来说已经是上乘水平了。」
    「那个未知峰的基因簇呢?」
    「还在注释。二萜合成途径的关键酶CYP450基因家族扩张很明显,比近缘种乌头多出七个拷贝。其中有三个序列跟已知的任何乌头硷合成基因都对不上——很可能就是那个新化合物的合成基因簇。」
    「来得及写进预印本吗?」
    「来得及。摘要和方法我已经写好了,结果部分现在补,今晚之前能定稿。作者就按你说的——我第一兼通讯,小周和小陈并列第二,红桥列在致谢。序列数据同步提交GenBank。」
    「bioRxiv上传需要几个小时?」
    「
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