顶点小说(biquge432.com)更新快,无弹窗!
序列本身不需要等结构确认。我们先把序列数据上传,占坑。然后再慢慢发论文。」
「谁来提取DNA?这个我不会。」钱解放终于抬头了。
「何建邦的学生。我昨晚跟他通了电话,他今天下午派一个博士生过来,带提取试剂盒。」
陈师傅听了半天,插了一句:「那些苗不能伤根。采叶片可以,一棵摘两三片嫩叶够不够?」
「够。nanopore对DNA量要求不高,几百纳克就能跑。」
「那我去剪。」陈师傅站起来,从工具袋里掏出一把消过毒的小剪刀。「哪棵?」
「最壮的那棵。二号苗。」
陈师傅走到二号苗前,蹲下,选了两片最嫩最完整的叶片,贴着叶柄基部剪断。
剪完他用镊子把叶片放进罗明宇递来的无菌离心管里,拧紧盖子。
两片叶子。整个操作不到三十秒。
「行了。」罗明宇把离心管装进冰盒。「下午博士生来了直接提取,晚上上机,明天出数据。」
孙立在旁边默默算了一笔帐——MinION二手四百八十美金,膜片一百二十美金,提取试剂盒大概两千块人民币,何建邦博士生的劳务费可以走课题经费。
总成本不到一万块。
「一万块钱保住一个物种的基因主权。」他自言自语。
「不是保住。」罗明宇纠正他。「是抢在别人前面公开。公开了就不是秘密,不是秘密就不能被垄断。」
他把冰盒交给钱解放,嘱咐放到地下工作室的-20度冰箱里,等博士生来。
走出大棚的时候,陈师傅追了两步。
「罗大夫。」
「嗯?」
「那个什么……基因序列,上传到那个什么库——」他费力地组织语言。「是不是全世界都能看到?」
「对。公开资料库,任何人都能下载。」
陈师傅沉默了一会儿。
「那别人看到了,拿去仿,不是一样的吗?」
「不一样。」罗明宇站在后山小路上,看着远处红桥医院的旧楼。「公开序列意味着任何人都不能独占。谁都能研究丶谁都能用——但谁也不能拿它来卡别人的脖子。这东西长在中国的土地上,它的基因信息应该属于所有人。」
陈师傅点了点头,虽然可能没完全听懂。
「那就好。」他说。「我祖上那些医书,也是这么个意思。写出来就是给人看的。锁在箱子里发霉,有什么用。」
他拄着有点跛的腿往医院走,走了几步又回头。
「罗大夫,我那膝盖今天该换药了。」
「下午来。」
「李师傅给我揉的那个方向不太对,上次往内侧偏了——」
「你跟他自己说。他有证了,你们同行之间聊。」
陈师傅哼了一声,拐进药房后门。
---
下午一点半,何建邦的博士生小周骑着电动车到了红桥医院后门,双肩包里装着Qiagen植物DNA提取试剂盒和一台可携式微量分光光度计。
钱解放带他下到地下工作室,腾出一块操作台。
小周打开冰盒,看到两片绿油油的叶片,眼睛亮了。
「这就是金线附子?」
「对。轻拿轻放。」钱解放在旁边盯着。
小周的操作很熟练——研磨丶裂解丶离心丶柱纯化,全程不到四十分钟。
最后用超微量移液器吸了一微升上NanoDrop,浓度38.7ng/μL,260/280比值1.91,质量非常好。
「够了。上机需要大概一微克,我有四十微升提取液,绰绰有余。」
钱解放已经把MinION连上了一台改装过的ThinkPad笔记本——原来跑的是Windows,他昨晚装了Ubuntu系统和MinKNOW软体。
膜片是今天上午到的,Flowcell拆封后他检了一遍活孔数,1247个,合格。
小周把文库制备好,加样,启动测序。
屏幕上开始出现跑动的硷基信号——绿色丶蓝色丶红色丶黑色的色块交替闪烁,像一条发光的河流。
「预计跑十二到十六个小时,明天早上出初步数据。」小周推了推眼镜。「基因组大小我估计在八到十亿硷基对左右,毛莨科植物一般都比较大。一次跑不完,但够出一个草图。」
「草图够提交GenBank吗?」罗明宇站在门口问。
「够。先提交scaffold级别的草图序列,后续再补充注释和精细组装。GenBank对草图级别的提交没有限制。」
「提交到发布需要多久?」
「正常审核一到两周。但如果走Fast-Track通道——」
「怎么走?」
「发表一篇预印本论文挂在bioRxiv上,附上GenB